小智告别了小霞与小刚又和皮卡丘踏上了旅行，可是在路上受到火箭队的干扰使的得小智和皮卡丘分散了，后来好不容易找到皮卡丘的时候，皮卡丘却受到港口的神奇宝贝恳求当老大。到底皮卡丘该怎么办呢？

*熔岩蜗牛，用火热的心来收服！
*神奇宝贝魔法大变身
*闪电鸟跟水晶，湖的秘密
*双胞胎的宝宝丁对抗胖了
*呆呆兽之悟，小智之悟
*假大木博士，神奇宝贝川柳对决！
*皮宝一之谓甚跟皮皮跟流星
*蚊香蛙的进化
*竟技公园VS水箭龟、喷火龙、妙蛙花
*牛蛙君跟拉拉队
*冰之洞穴
*小春与迷你龙
*烟墨道馆的龙之牙
*快龙的逆袭立起
*烟墨倒馆最后的徽章
*道馆徽章与小果然翁
*龙宫道馆再水中的战斗
*乘龙之歌
*保护蛋，在暴风雨诞生的生命
*炎帝与在温泉的伙伴
*河马王王者的信物
*奈奈与电击怪
*加油吧！由基拉
*狃拉与圣火
*白银山大会！与小茂再度重逢！
*预赛联盟火焰的战斗
*大菊花VS.妙蛙种子 草系神宝的尊严
*决胜淘汰赛！全体战斗
*劲敌对决！水箭龟VS喷火龙！
*遇上火鸡战士！与羽月的对决
*全体战斗的成果！分别的道路
*再见和启程
*和比卡丘分离